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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

时不时作为一个石油化工食材而被询问世界的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“分解废品”为“神秘宝藏小团伙”的心路以来以来一样,知道近十几种年才被感觉其重要的的物理学学特点,如果有一天“起身农奴把独唱”,格外是在免疫力宫颈真菌感染性传染类的疾病科研这个领域内异彩纷呈。至今几篇整形论文新闻稿件了在各个宫颈真菌感染性传染类的疾病的动植物对模型中享有衣康酸或其化工呈现衍物理学的手术治疗益处,并感觉其意向靶点。并于衣康酸的“今世来世”与“今世”,具体情况见微信推文《乳酸的逆袭吧亲兄弟——衣康酸!篇文章和你一起询问衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化遮盖血清组学产品,实现1000+玄之又玄度呈现位点排除,安全逆转原素靶点,全位子生信阐述解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“看见”到“印证”全流量售后服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、研究具体步骤

02、测试参数参数

03、经“点”逆转

在监测数据报告中,检测多条论文资料中简讯的经典的靶点十分衣康酸体现位点,如首位个被看见的衣康酸共价体现蛋清KEAP1,和糖酵解径路中的3个重要酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,或炎性小体构造蛋清NLRP3和受损细胞细胞坏死的过程中的重要蛋清RIPK3等,其质谱图一下图右图。

04、商品结构特征

1.各种方面质控

房地产业化特情人探头孵育、SDS-PAGE判断、WB手机验证、模本相关内容性具体分析等一定要多地方位判断,保持活动成果靠谱性。

2.高耐热性质谱议器网站

在Orbitrap Astral全新一批高签别质谱仪带动下,控制衣康酸性反应淡化位点及蛋白质司法鉴定新长度,助力器数学研究课题科学新发现了。

3.全流程图一走式贴心服务

源于拜谱生物制品改善的實驗游戏平台,可展示 “生殖细胞培養→测试探针孵育→WB检查→高妙度衣康酸性反应遮盖检查→专用生信分析一下→其他位点PRM核实”全环节服務,省时省劲更好些。

05、阐述文章(大部分)

06、技术应用方向盘

PART 2、学术论文分析

论文参考文献一

日语微信标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

2英文宝贝标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

探究方面:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

期刊论文二

英文怎么说一级标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

常常子标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

学习项目:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、例产生难点

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13享有具有的底物配合效率,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物制品衣康酸性反应体现组评测数据信息中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应掩盖(以下图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱个人总结

为TCA嵌套循环中的当中代谢转化率率物,衣康酸调整代谢转化率率、抗体和真菌感染当中的主动印象,为诊治方法抗体真菌感染性疾患可以供应了换用诊治方法手段。衣康酸空间构造中的亲电性α,β-不呈现饱和状态羧酸空间构造能对球脂肪酸上的催化活性半胱氨酸残基做烷基化遮盖语(迈克尔增加印象),此译为后遮盖语被被视为“衣康酸遮盖语(itaconation)”,从而印象球脂肪酸工作,自我调节抗体初次应答和代谢转化率率路经,为四种疾患食用的药物生产制造可以供应新难点。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用体现血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物生物学可以说化学发光法靶点消化吸收组(QMT1000)或卡路里基础新陈代谢靶点基础新陈代谢组企业产品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

对比文献资料

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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