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拜谱新品发布| 免疫肽组,基于质谱的新生抗原鉴定与筛选

发布时间:2024-09-26
T内部才可以分辨癌肿内部表皮的具体聚集相溶性复合材料体(MHC)呈递的抗原而解锁天然天然免疫性体现。MHC I类(MHC-I)氧原子结构与CD8+ T内部间接的功效,其呈递的肽具体因素于内源性胞质蛋清的蛋清酶体光挥发,而MHC II类(MHC-II)氧原子结构具体把你想表达出来于正规抗原提呈内部,与CD4+ T内部间接的功效,其呈递的肽位于采用内体路线光挥发的胞外和胞内蛋清(图1)。从而,分辨由MHC氧原子结构呈递的癌肿抗原就定制依懒T内部分辨和烧死癌肿内部的有效果和卫生的淋巴肿瘤天然天然免疫性治疗方案是至关很重要的。系统设计质谱(MS)的天然天然免疫性肽组学(Immunopeptidomics)才可以从不同内部系、癌肿聚集和营养健康聚集中mtk量、就直接鉴定会MHC根据肽。

拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抗原聚集MHC试述运用肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫检测肽编码序列及其翻译专业后突显数据信息,提高基因测序的真实度,并采用De novo从后测序技術,不依赖现有数据库,极高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且多的数据文件分折文章为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!

图1 MHC-I和MHC-II呈递肿癌抗原的方式

(图源:Xie et al.Signal Transduction Targeted Ther. 2023)

NO.1 实验室环节

NO.2 產品亮点

NO.3 研究的内容(组成部分)

NO.4 送样小编建议

经典案例阐述

01 工作机制分析

软文题型:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells

刊登报纸:Science Advances IF:11.7 2024

XPO1 (Exportin-1/CRM1)是种核伤害蛋清,在癌证中三天两头过表达爱,做以为癌症再次发生的动力各种因素。阶段,靶向治疗XPO1的小原子核正被充当临床试验治疗癌症类药物。

作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用天然免疫肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。

图2 另一种始于XPO1的肽是KIR2DS2的配体

(图源:Blunt, Matthew D et al.,Sci Adv. 2024)

02 恶性肿瘤-免疫抗体制疗

一篇文章一个题目:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors

发过自媒体:Nature Communications IF:16.6 2023

恶变胸膜间皮瘤(MPM)都是种生存率异常的入侵性肉瘤。犹豫目前有的的调理计划方案缺乏性成效,为此重要要新的的调理策略性。本着其T细胞膜侵润,著者有效市场理论MPM都是个适合使用的的调理性胃癌防疫针的对象。

迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用研究背景质谱的免疫抗体肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。

图3 恶劣胸膜间皮瘤抗体肽组学检侧

(图源:Chiaro, Jacopo et al.,Nat Commun. 2023)

03 病菌mRNA预苗设计规划

小文章之类:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes

发过杂志网站:Nature Communications IF:16.6 2023

单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过体系结构质谱的免疫细胞肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。

图4 在李斯特菌染上的Hela肿瘤细胞核和HCT-116肿瘤细胞核中技术鉴定MHC I呈递的抗原肽。

(图源:Mayer, Rupert L et al.,Nat Commun. 2022)

拜谱总结

受损组织安排核免役性受损组织安排核肽组学是血清质组学的某个迅猛的发展的支系,它悉心于研究方案受损组织安排核免役性受损组织安排核系统中由一般组织安排开展混溶性复合型体(MHC)或人类红受损组织安排核抗原(HLA)碳原子呈递的受损组织安排核免役性受损组织安排核肽。这部分受损组织安排核免役性受损组织安排核肽是受损组织安排核外层呈递的肽段,才能被T受损组织安排核快速精确,才能闪避受损组织安排核免役性受损组织安排核发生反应。鉴于质谱的受损组织安排核免役性受损组织安排核肽组学现在已经变成 鉴定费结论MHC血清呈递肽的金标准的策略,才能随便鉴定费结论有差异生理问题和病理学感觉下有差异组织安排开展和受损组织安排核方式中的受损组织安排核免役性受损组织安排核肽组,诸如线下瘤或病毒是什么细菌或病毒的入侵的受损组织安排核。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的蛋清组学、细胞代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫细胞肽组检测工具精准服务,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,是可以明确且之间可以提供免疫性检测肽字段,会发现很多非具代表性免疫性检测肽,逐渐挑选出牢靠新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。

规范资料

1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y
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