草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿操作设备常用见的疫情之五。肾组织结构中CaOx硫化锌过供大于求沉淀积累会引致肾小管组织受伤和凋亡，才能引致肾结石的形成了。短链蛋白质酸由肠内内活性污泥法细菌病毒发醇伙食纤维棉有，除了在小面积的肠内防线中利用做用，可是在操作设备平均水平上也利用关健做用。里面，丁酸是最非常丰富的短链蛋白质酸，存在免疫系统压制和免疫系统压制做用,本科研探析丁酸对CaOx肾结石的做用举例说明自身靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医院口腔科泌尿整形科吴忠教受、周子健硕士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠讲师、周子健搏士在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物体与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了系统临床药理学售后服务，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

新闻稿件名字：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 企业机构：华山专科医院 论述人群：大鼠、HK-2生殖细胞 分组名称信心：比对组（Con）、类别组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱能提供技术应用：wifi网络临床药理学在线检测

设想流程步骤图

科学研究报告

研发人工第一方面融合大鼠仿真建模工具，完成生理学什么是生化完成指标和策划 病症学复染等研发科技手段察觉到丁酸可不可以减掉CaOx仿真建模工具大鼠肾CaOx尖晶石的组成和断裂，改善CaOx仿真建模工具大鼠的炎症病变断裂和防氧化的的物质的过快表明。凡此种种，丁酸还可调控草酸分析的HK-2内部断裂、防氧化的应激性和内部凋亡。 为探究性丁酸组成和靶DNA互联网，科研员从PubChem添加丁酸和丁酸酯的二维和三维立体组成（图1A）。顺利通过PharmMapper资料信息库和Uniprot资料信息库清理后共挑选出11七个丁酸靶DNA供进一大步定量数据定性分析。将DNA列表页加入STRING资料信息库，实现PPI互联网定量数据定性分析。Cytoscape根据了排名的前20的核心靶DNA的基本互联网图，收录CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这样核心DNA与互联网中的各种DNA均具体表现出肯定的关于性，阐明这样DNA机会挥发着分工协目的。GO和KEGG定量数据定性分析蕴含了丁酸核心DNA的关于渠道和生理学学工作（图1C）。核心DNA首要与类固醇刺激性素药回话、硫化的应激性现象回话、渗透性氧体细胞对类固醇刺激性素药刺激性的现象和对弱酸性化学工业杂质的现象有关。与此同时与此同时，这样核心DNA首要参与进来了硫化的应激性现象和对渗透性氧的生理学现象工作，是肾结石确立缘由中至关重点的渠道，这表述丁酸机会在肾结石中挥发重点用。

图1| 丁酸结构的与靶基因遗传无线网络研究分析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进步骤探秘丁酸对CaOx肾结石确凿切靶表观遗传，探索工作员管理充分利用GEO数据分析信息库对GSE73680中稳定对应与CaOx肾结石患儿的表观遗传差异化实现了探索。对应组与CaOx结石患儿的不错性能差异化展示表观遗传（DEGs）dna组检测的标准为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共挑选到3783个表观遗传时有发生不错變化，这里面3379个（89.4%）表观遗传展示上浮，404个（10.6%）表观遗传展示调低（图2A）。对DEGs实现聚类分析法分析一下分析一下，热图信息显示了前10个被选中DEGs的二维等级聚类分析法分析一下结构特征（图2B）。接着随后，探索工作员管理在GeneCards数据分析信息库人工工资签定了370个也许 与CaOx肾结石有关的的表观遗传，排名榜前20位的予测表观遗传非常有关的性評分图甲2C如图所示。要想寻到丁酸手术治疗CaOx肾结石的重要的靶点，探索工作员管理将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关的表观遗传工作获得半个个Venn图。后面，CYP2C9被确立为丁酸功用CaOx肾结石的风险靶点(图2D)。另外，探索工作员管理还实现了丁酸与CYP2C9的大分子联结，CYP2C9的四个碳水化合物残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸间接功用，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在灵活运用网咯药学学预计CYP2C9是丁酸直接影响CaOx肾结石的靶dna后，探究工作员还能够内部试验断定了CYP2C9可减小草酸诱惑的HK-2内部的ROS质量、发炎伤害和凋亡。

图2| 往往据库连合分折分析CYP2C9是丁酸效用于CaOx肾结石的靶表观遗传

论述的结果

本研究分析要发觉丁酸在内和内均能压制CaOx肾结石模式的阳极氧化物应激反应反应和慢性细菌感染病变软组织受伤，接着随后完成电脑网路药剂学学学挑选得到了丁酸反应CaOx肾结石的意向靶点——CYP2C9，最后一步完成血细胞系实验操作验证CYP2C9在草酸盐促进的HK-2血细胞系ROS水准、慢性细菌感染病变软组织受伤和凋亡。这样发觉取决于丁酸也许 完成压制CYP2C9来压制CaOx肾结石的阳极氧化物应激反应反应，可减轻慢性细菌感染病变软组织受伤。这些环节中拜谱菌物打造了电脑网路药剂学学学科技提供服务性，除此之外拜谱菌物可不断提高稳定完整的基因遗传组学、血清质组学、消化吸收组学等多个学產品及科技提供服务性，热情接待致電在线咨询！ 符合毕业论文：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.