代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
耐腐蚀无机化学物质判定会：分泌转化组学方法性就能够对中医中的耐腐蚀耐腐蚀无机化学物质进行周全了解，判定会出补品中的几丁质酶耐腐蚀无机化学物质。列如，利用应用于质谱（MS）的分泌转化组学方法性，是会判定会出高丽参中的高丽参皂苷等几丁质酶耐腐蚀无机化学物质。类似这些方法性还是会界定入药和非入药有些的耐腐蚀标注物，为中医的产品抑制展示前提条件。
线的品质的的控制：经过基础分泌率组学技术应用，可能对西药的线的品质来进行评估报告和的的控制。比如，灵活运用观赏作物基础分泌率组学探索，可能開發面向类骨质增生性软骨炎的西药的成分表表的线的品质标记符号的降钙素原检测步骤。除外，基础分泌率组学还可能鉴别西药中的渗透性的成分表表基本渗透性机能，如经过UPLC-Q-TOF-MS探索，鉴别各种不同乌头观赏作物的化学上的成分表表，并鉴别含有镇疼生物学和急慢性渗透性的生物学碱。
2. 中药药效机制研究
用处靶点正常快速精确：排泄组学技艺行有所帮助正常快速精确中成药生物材料的氧分子靶点。比如，研发发现雷公藤红素可能够自动调节Treg/TH1和Treg/Th17均衡、传导NF-κB信号通路等措施展现抗感染用处。
功效考核长效系统阐述：分泌率组学科技才应该阐释中成药治愈疾病症状的功效考核长效系统。假如，深入了解挖掘青蒿素耐药性与疟原虫的线粒体分泌率优化重要性联，非靶点分泌率组学阐释了与该进程重要性的分泌率物变换。凡此种种，分泌率组学还应该能够 了解分泌率物的变换，深入了解中成药复方的功效考核长效系统。
3. 中药安全性评价
致毒系统深入分折：排泄率率组学技木是可以使用深入分折成药的致毒系统。举列，能够 排泄率率组学和16S rDNA测序的合并分折，反映了清益汤对危重症慢性胰腺炎涉及到慢性肺磨损的保证系统，并确保了铁沉积、不同排泄率率物和微怪物菌群互相的影响。
应急防护高性评价报告：新陈代谢组学系统还可能适用于中药配方配方的应急防护高性评价报告，甄别风险的毒副作用化学物质和毒副作用靶点，为了为中药配方配方的应急防护高适用提供数据合理根据。
4. 中医证候研究
证候重要性分泌物浅析：分泌组学技術也可以使用表现与中醫证候重要性的内源性分泌物转化，助手中醫证候的初步判断和预防。举例说明，顺利通过分泌组学探讨，已在冠心脏病的人中监定出与痰瘀证和和气气阴两虚证重要性的生物技术标志logo物。
证候诊治深入探讨：基础排泄组学枝术还可不可以用到深入探讨中要对中醫证候的诊治成果。举例说明，凭借基础排泄组学枝术及聚类探讨法探讨法，发展“黄芪-茯苓-泽泻”等关系用药选用适于到肾病结合性征的新组方用药，才可以对各种肾病结合性征想关的生态学标志的意思物有后果。
5. 多组学技术整合应用
几组学聚合：代谢转化组学与其他的组学技术应用软件软件（如基因组组学、转录组学、球营养素组学等）的聚合应用软件软件，为草药研发给出了了个多特点的阐述骨架。这一聚合应用软件软件仅仅变大了人们对草药含量在分子结构层面应用上上对身休生理问题和疾病状态下的影响力，还有就是为阐明草药的效用缘由和疗效有机化合物基本知识给出了强有劲的生产工具。
问题控制规则：几组学方法能否使用于钻研中成药控制问题的碳原子规则。列如 ，经由核氨基酸组学和新陈排泄组学的结合用，证明了与医学类别的膝骨骨节骨性骨骨节炎密切联系重要性的差异化表达出核核蛋白和新陈排泄径路。
代谢转化组学新技术在药材实验中的广泛应用，为药材的现在化和精淮医疗卫生保证了注重的科学学支技，促进促进推动药材的基准化和国外化未来发展。