
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱海洋生物 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探索結果
科学研究考生探究性伴随要在冷冻室保存时段延伸鸡肉的洛氏抗拉强度、持反击式水轮机、色度、解离铁纯度、ROS、脂质过防氮化合物、MDA、GSH和GPX4级别来估评肩部肌肉阻止生殖细胞核的铁去世动态。没想到展示,要在冷冻室保存时段延伸后,鸡肉的洛氏抗拉强度在第四天和第6天更为明显走低;持水作用减低;背景颜色变深,丢失油润,鲜色成为暗色。虽然,解离铁、可溶性氧和MDA的纯度更为明显增添,生殖细胞核凋亡率更为明显变高。 研发成员提现各不相同要在冷藏室保存事件的健身背部肌肉原辅料的淀粉酶质,最后做出SDS-PAGE深入阐述,淀粉酶质条带在各不相同十六国时期规划不光滑且关联性性(图1a)。随着淀粉酶在各不相同原辅料中的表述事情,深入阐述发现不同时间组原辅料的中十位数临近于不同时间横向(图1b),说健身背部肌肉原辅料淀粉酶质兼备稳定的组内关联性性性和组间地域差男人。 淀粉酶酶质组学共监定出1996种淀粉酶酶质。以B0为较组,需求B1、B2、B4和B6中的淀粉酶酶实行距离表示爱做法分折,共监定到376个DEPs。将火山图可视化深入分析,并据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.055个基准分折DEP。结论信息显示如下图下图1c-f下图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别监定出22、33、73和140个DEPs,表中分头别上涨6、11、32和84个,下降16、22、41和55个。聚类分析法做法鉴定了各种冰箱准确时间段胸肌团队中淀粉酶酶质的表示爱做法,结论信息显示信息显示胸肌淀粉酶酶表示爱做法距离由于存放准确时间的曾加而曾加(图1g)。
图1| 有差异保鲜冷库时的腹肌土样蛋白酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不一样的保鲜时刻的脂肪检样一定的差异淀粉酶定性分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁身亡核蛋白肽的PRM化学发光法具体分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 由于KEGG含有差异化传达淀粉酶的铁消亡策略(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱海洋生物提供了TMT酶联免疫法球蛋白酶质组学科技精准服务培训,拜谱怪物已研发管理完工并建立起了加强完善的转录组学、球蛋白酶组学、代谢转化组学及几组学整合食品科技精准服务培训组织体制,欢迎致电咨询!
参看医学文献:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.